（一）負責貫徹執行國家、重慶市生態環境基本制度。負責貫徹執行生態環境法律法規、規章、標準和方針政策，根據職責和授權實施有關法規、規章和規范性文件，組織實施生態環境標準和技術規范。會同有關部門擬訂生態環境政策、規劃并組織實施。會同有關部門編制并監督實施重點區域、流域、飲用水水源地生態環境規劃和水功能區劃。
（二）負責重大生態環境問題的統籌協調和監督管理。建立健全突發生態環境事件的應急預警機制。牽頭協調環境污染事故和生態破壞事件的調查處理，指導協調鄉鎮（街道）對突發生態環境事件的應急、預警工作。牽頭指導和實施生態環境損害賠償制度，協調解決有關跨區域的環境污染糾紛。統籌協調重點區域、流域生態環境保護工作。
（三）負責監督管理減排目標的落實。監督實施各類污染物排放總量控制、排污許可證制度，組織確定水、大氣等納污能力，監督檢查污染物減排任務完成情況，實施生態環境保護目標責任制。
（四）負責提出生態環境領域固定資產投資規模和方向、財政性資金安排的意見，配合有關部門做好組織實施和監督工作。
（五）負責環境污染防治的監督管理。擬訂水、大氣、土壤、固體廢物、化學品、機動車、噪聲、光、惡臭等污染防治管理制度并監督實施。會同有關部門監督管理飲用水水源地生態環境保護工作，負責流域水環境保護，監督防止地下水污染。負責入河排污口的設置管理。組織指導城鄉生態環境綜合整治工作，監督指導農業面源污染治理工作。監督指導區域大氣環境保護工作，組織實施區域大氣污染聯防聯控協作機制。
（六）指導協調和監督生態保護修復工作。組織編制生態保護規劃，監督對生態環境有影響的自然資源開發利用活動、重要生態環境建設和生態破壞恢復工作。組織擬訂各類自然保護地生態環境監管制度并監督執法。監督野生動植物保護、濕地生態環境保護、荒漠化防治等工作。指導協調和監督農村生態環境保護工作。監督生物技術環境安全，牽頭生物物種（含遺傳資源）工作，組織協調生物多樣性保護工作。參與生態保護補償工作。
（七）負責核與輻射安全的監督管理。牽頭負責核安全工作協調機制有關工作。監督管理核安全和放射源安全，監督管理電磁輻射、核技術應用、伴有放射性礦產資源開發利用中的污染防治。組織開展核與輻射環境監測工作。負責輻射環境事故應急處理，參與核事故應急處理。
（八）負責生態環境準入的監督管理。受縣政府委托對重大經濟和技術政策、發展規劃以及重大經濟開發計劃進行環境影響評價，按規定審批或審查重大開發建設區域、規劃、項目環境影響評價文件，組織實施生態環境準入清單。
（九）負責生態環境監測工作。貫徹執行生態環境監測制度、規范和相關標準并監督實施。規范應用生態環境監測網、生態環境信息網，按要求設置生態環境質量監測站點。組織實施生態環境質量監測、污染源監督性監測、溫室氣體減排監測、應急監測。組織開展生態環境質量狀況調查評價、預測預警。建立和實行生態環境質量公告制度，統一發布生態環境質量狀況和重大生態環境信息。
（十）負責應對氣候變化工作。貫徹執行應對氣候變化及溫室氣體減排重大戰略、規劃和政策，承擔國家履行聯合國氣候變化框架公約在我縣的相關工作，組織開展應對氣候變化相關工作。
（十一）組織開展生態環境保護督查。負責建立健全生態環境保護督查制度。對接中央生態環境保護督察和市生態環境集中督察等有關工作。承擔縣政府開展生態環境保護專項督查工作。
（十二）負責生態環境監督執法。組織開展生態環境保護執法檢查活動，查處重大生態環境違法問題，以及跨區域、跨流域的生態環境違法問題。具體執法交由巫溪縣生態環境保護綜合行政執法支隊承擔，并以部門名義統一執法，指導鄉鎮（街道）和相關縣級部門開展生態環境保護執法工作。
（十三）負責開展生態環境科技工作。組織開展生態環境科學研究和技術工程示范，推動生態環境技術管理體系建設。參與指導循環經濟和生態環保產業發展。
（十四）組織開展生態環境宣傳教育與對外合作工作。制定并組織實施生態環境保護宣傳教育綱要，推動社會組織和公眾參與生態環境保護。組織開展生態環境對外合作交流，組織協調有關生態環境國際條約在我縣的履約工作。
（十五）承擔巫溪縣生態環境委員會的日常工作。
（十六）負責機關、所屬事業單位和主管的社會組織的黨建工作。
（十七）完成縣委、縣政府交辦的其他任務。
????（十八）職能轉變。巫溪縣生態環境局要統一行使生態和城鄉各類污染排放監管與行政執法職責，切實履行監管責任，全面落實水、大氣、土壤污染防治行動計劃。構建政府為主導、企業為主體、社會組織和公眾共同參與的生態環境治理體系，實行最嚴格的生態環境保護制度，嚴守生態保護紅線和環境質量底線，堅決打好污染防治攻堅戰，保障生態安全，加快建設山清水秀美麗巫溪。
